工程预算在目前审计机关审计任务日益繁重 ，而审计力量相对有限的情况下 ，审计人员如何根据工程项目的实际情况选择工程预算审计方法，以便提高审计效率，又快又好地完成审计任务随着 经济快速发展及投资的增长，建设项目投资审计受到社会各界的空前重视。工程预算审计是政府投资项目审计的重要组成部分，特别在节约建设资金、提高项目管理水平方面具有显著作用。近年来，随着政府基本建设力度的加大，投资审计倍受社会各界关注，各级政府部门对投资高重视，这对审计机关和审计人员来说，既是一种鼓励，
工程预算审计组长的职责（1）确定跟踪审计小组人员的分工和岗位职责。（2）主持编写项目跟踪审计实施方案，负责跟踪审计项目的内部管理和外部协调工作。审阅重要的咨询成果文件，制定咨询原则，处理重要技术问题。（3）负责跟踪审计项目内各层次、各专业人员之间的技术协调、组织管理、质量管理等工作，处理审核人、校核人、编制人员之间的技术分歧意见，对形成的咨询成果质量负责。（4）根据项目实施方案，动态掌握项目造价变化情况，负责确定阶段控制目标，进行风险预测，分析偏差制定纠偏措施。（5）组织编写咨询成果文件的总说明、总目录，审核成果文件。
对分包工程合同履行过程的事中审计监督是分包工程全过程跟踪审计的第二步。审计的重点是分包工程量计量、施工现场变更、材料使用等审计要素工程量计量的准确性，现场签证的真实性。工程量的大小决定着分包工程的终造价，是确定分包工程预算的根本。工程量的准确性，将直接决定着分包工程的审计质量。事中审计监督就是要突出对分包工程实施过程的审计，强调变更签证工作量的现场审计。内审人员要按施工阶段定期或不定期地深入施工现场，对实际发生的工程量，进行现场丈量和取证核实，落实变更签证确认程序和内容的合理性，是否存在违规签证，虚增工程量，提高分包工程量的真实性和准确性。
工程预算审查结算工程量计算的准确性。根据经过多部门竣工验收而终确认的工程量和工程量计算规则，审查结算工程量的计算。工程量计算的是否准确直接影响着分包工程的计价。因此，在审查工作量时应正确划分项目，按照施工图的设计说明和 规定的计算规则计算，实事求是的反映真实工程量。审查定额子目套用和费率计取的正确性。首先，检查子目列项的名称、规格、计量单位与地区估价表是否一致，定额换算是否准确；其次，查看定额所列工程内容，检查套用的定额是否重复、高套或错套。审查取费标准或综合单价及费率与分包工程合同价格条款约定是否相符，综合费率是否准确，综合单价是否正确，套用综合单价的工程内容是否重复、交叉、错列。